目前从输业发展的水平和状况，都已经到了必须从更高层次制定运输政策的阶段，即不仅考虑每种运输方式各自的系统效率，更要同时考虑综合运输、高效物流体系、全球化和可持续发展层面的问题，要求相应更高级别的综合管理部门发挥主导作用。
为此我们南京运输公司提出以下四点提高运输效率的建议：
一、抓紧时机成立运输部。实现运输一体化必须要有组织机构和体制上的保证，综合运输主管机构运输部的组建，在很大程度上是我国综合运输体系能够尽快形成和进入良性运行的先决条件。
二、明确综合运输规划主体。要尽快落实分级综合运输规划和实施的主体。除了要继续重视地区间运输通道的规划，也要加深对城市交通(包括市内、市郊及城市群内城际交通)的认识，重视城市综合规划对运输业进一步发展的重要作用。
三、南京货运公司确立综合运输规划的权威性。各种运输方式基础设施在物理上的相互连接或结合，是实现一体化运输服务的基础，而运输设施规划与设计一体化理念、工作程序和规范标准的形成，一定是有赖于综合运输管理体制的形成。